132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3801 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 474 aa  982    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  62.42 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  57.48 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  31.02 
 
 		 467 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  31.33 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  33.89 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  29.01 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  28.66 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  31.01 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  26.71 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  25.64 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  25.05 
 
 		 449 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  27.63 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  27.76 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  29.3 
 
 		 451 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.84 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  27.66 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  28.25 
 
 		 454 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  30.16 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  23.65 
 
 		 481 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  24.31 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  28.74 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  26.21 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  26.4 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  23.39 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  26.24 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.66 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.1 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  28.23 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.03 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.89 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.4 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  33.09 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  31.34 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 491 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 456 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  32.82 
 
 		 534 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  21.64 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  22.3 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 493 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  29.29 
 
 		 507 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  24.57 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  31.3 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  24.49 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 494 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  35.8 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  22.61 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.33 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 542 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 532 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 480 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>