90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0306 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  996    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  49.28 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  50.64 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  49.28 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  44.62 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  36.65 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  37.42 
 
 		 497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  27.38 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  26.01 
 
 		 451 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  24.11 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  27.01 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.57 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  24.85 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  23.32 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  25.4 
 
 		 459 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 469 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  23.65 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  24.65 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  22.38 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  24.23 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.76 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  24.75 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  23.97 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  27.66 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  25.12 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  30.54 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  22.64 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  22.03 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  35.14 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  21.57 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 556 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 613 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  33.33 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  30.43 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 664 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 618 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.59 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  22.85 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  31.47 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.39 
 
 		 458 aa  47  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  21.98 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  21.45 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 612 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 481 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 480 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 528 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 503 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 530 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>