171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4672 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 440 aa  899    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  32.41 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  28.76 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  28.6 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  26.71 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  28.57 
 
 		 459 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  25.73 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  27.6 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 475 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 484 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  27.51 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  26.45 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  28.1 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  29.22 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  25.87 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  27.33 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  25.84 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 486 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 456 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  24.74 
 
 		 467 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  25.57 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 494 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.42 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 484 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 479 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  26.65 
 
 		 497 aa  86.3  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.25 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  24.74 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  25.4 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.64 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  25.39 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.25 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  23.33 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  23.22 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5146  hypothetical protein  24.05 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000128117  hitchhiker  0.00789925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  27.03 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.22 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  34.09 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.63 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  21.04 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2217  hypothetical protein  24.06 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  29.35 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>