165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2880 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  942    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  52.69 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  32.65 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  29.44 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  29.85 
 
 		 459 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  29.12 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  29.36 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  29.91 
 
 		 449 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.93 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  27.52 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  26.18 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  27.29 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  26.71 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  28.54 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  26.45 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  26.96 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  25.05 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 461 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 452 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  24.65 
 
 		 481 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.07 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  25.8 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  24.6 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  23.81 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  24.02 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  22.12 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 476 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  24.8 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  23.93 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  22.57 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.57 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  25.34 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0785  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  23.29 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.56 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  23.65 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  22.48 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.81 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  24.88 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>