123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6127 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  100 
 
 		 437 aa  885    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4522  putative lipoprotein  33.26 
 
 		 438 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0748401  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01950  hypothetical protein  33.55 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1703  putative lipoprotein  31.05 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  23.96 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.81 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  40.54 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  23.29 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4506  hypothetical protein  34.17 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4223  hypothetical protein  47.73 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.355656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  38.75 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0538  hypothetical protein  30.07 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.31 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.27 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  35.11 
 
 		 555 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 582 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 504 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.03 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 480 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 472 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  34.52 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  34.09 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  38.96 
 
 		 574 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  36.25 
 
 		 639 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  22.65 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  22.1 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  37.35 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  38.83 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  34.48 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  33.63 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  27.41 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32.47 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  23.46 
 
 		 452 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 574 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5531  hypothetical protein  36.49 
 
 		 564 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0122802  normal  0.901162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  33.06 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  35.23 
 
 		 497 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  32.98 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  31.86 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  35.58 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  32.81 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  39.78 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.68 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 579 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  34.31 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.74 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  34.62 
 
 		 565 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  32.74 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  33.98 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 592 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  35.51 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  22.68 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  39.77 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  32.32 
 
 		 568 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  33.98 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  22.19 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.33 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>