136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1703 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1703  putative lipoprotein  100 
 
 		 442 aa  901    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4522  putative lipoprotein  35.75 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0748401  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01950  hypothetical protein  30.82 
 
 		 447 aa  194  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  31.05 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.01 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.1 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  40.82 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  40.95 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  34.92 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  40.7 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  24.59 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4506  hypothetical protein  36.73 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  32.52 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.66 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  42.11 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  38.21 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  42.67 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.74 
 
 		 494 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  29.07 
 
 		 515 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  31.13 
 
 		 498 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  37.62 
 
 		 501 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  36 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 499 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  23.94 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  40.51 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  40.7 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  36.9 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  40.54 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 576 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  41.03 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 522 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  40 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  35.8 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  35 
 
 		 500 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  32.98 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 486 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  37.04 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  34.09 
 
 		 512 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  35.64 
 
 		 492 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  36.54 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  32.46 
 
 		 572 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  33.61 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  32.98 
 
 		 614 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  37.35 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  40.66 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6807  hypothetical protein  31.31 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  hitchhiker  0.0000033476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  38.82 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  35.63 
 
 		 599 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  34.12 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  22.44 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  35.05 
 
 		 564 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  37.63 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 510 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 479 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  35.96 
 
 		 574 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1782  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 510 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 611 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  35.48 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  34.12 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>