20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6807 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6807  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  876    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  hitchhiker  0.0000033476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4506  hypothetical protein  43.5 
 
 		 436 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  25.09 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  21.23 
 
 		 488 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  29.55 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.13 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1703  putative lipoprotein  31.31 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  23.65 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  37.5 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  25.73 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  25.44 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  34.34 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.18 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  32.94 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>