185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1551 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 503 aa  1033    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  30.09 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  28.53 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  27.9 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.05 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 491 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 475 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.34 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  23.61 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1575  hypothetical protein  24.95 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.0694567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  28.01 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 664 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  23.76 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  22.92 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  21.85 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.79 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  25.38 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  26.18 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  24.11 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.85 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  25.89 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  27.61 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  26.36 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  23.91 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 503 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 480 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  23.56 
 
 		 449 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  24.3 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.07 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 591 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  24.21 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  21.75 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  20.41 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  21.84 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  22.98 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  24.82 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  25.28 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  21.33 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>