258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2226 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  67.71 
 
 		 574 aa  817    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 577 aa  1202    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.8 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  22.93 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 582 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 576 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.21 
 
 		 507 aa  100  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 592 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 501 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  21.85 
 
 		 579 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 523 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 507 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 531 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 592 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 540 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 534 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  22.64 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 522 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 512 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  23.61 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 601 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.76 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 588 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 603 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 618 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  22.19 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  22.94 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  21.51 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 462 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 664 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  22.3 
 
 		 592 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.38 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.3 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  21.61 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  22.64 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  22.71 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  20.98 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  22.73 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  22.12 
 
 		 617 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  20.74 
 
 		 540 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  22.42 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 531 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  22.26 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  22 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  22.02 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  22.32 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.07 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  21.04 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.08 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 612 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  25.94 
 
 		 446 aa  67  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 549 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  22.2 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  21.6 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>