241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7233 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 538 aa  1122    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  50.1 
 
 		 527 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  45.82 
 
 		 537 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  34.77 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  34.6 
 
 		 493 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  33.69 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  32.12 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 539 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 543 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  31.56 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  32.18 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 538 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 530 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 575 aa  163  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 530 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  26.18 
 
 		 519 aa  143  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 515 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  26.75 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 555 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.87 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 562 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 486 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 498 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 499 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 549 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.69 
 
 		 498 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 502 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 499 aa  88.2  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 476 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.95 
 
 		 490 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.8 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.11 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  33.52 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  22.77 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  22.11 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.98 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.43 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 557 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 484 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 464 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  21.78 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  21.56 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  22.02 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  22.3 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  24.14 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  21.8 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 622 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>