More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0276 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  64.62 
 
 		 582 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 582 aa  1194    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  61.88 
 
 		 579 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  50.08 
 
 		 592 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  51.96 
 
 		 601 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  46.43 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  46.03 
 
 		 588 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  47.15 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  43.45 
 
 		 594 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  41.98 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  42.22 
 
 		 592 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  42.24 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  38.13 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  33.72 
 
 		 556 aa  225  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.49 
 
 		 499 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 508 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.16 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.61 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  29.61 
 
 		 507 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 579 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 507 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.22 
 
 		 494 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 477 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.79 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.42 
 
 		 511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 479 aa  137  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.21 
 
 		 490 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 486 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 501 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 495 aa  127  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 523 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 494 aa  122  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 478 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 529 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  23.78 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 505 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 510 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 486 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 639 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 561 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 577 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.61 
 
 		 487 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.46 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 568 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.44 
 
 		 506 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 498 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 513 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.91 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 540 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 540 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 503 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 527 aa  94.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.98 
 
 		 476 aa  94.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 469 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 582 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 500 aa  91.3  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 531 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 481 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 486 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 521 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 531 aa  90.5  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 564 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  24.93 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 502 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  34.08 
 
 		 460 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>