281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1602 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  100 
 
 
570 aa  1194    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  46.95 
 
 
556 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  37.21 
 
 
592 aa  335  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  36.95 
 
 
594 aa  334  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  38.97 
 
 
576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  37.56 
 
 
582 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  36.07 
 
 
601 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  36.77 
 
 
592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  36.89 
 
 
582 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  35.49 
 
 
588 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  34.82 
 
 
598 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  36.69 
 
 
579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  34.26 
 
 
579 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  32.62 
 
 
592 aa  253  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.51 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 
541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.85 
 
 
499 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 
477 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 
508 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 
506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.77 
 
 
494 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 
511 aa  146  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.09 
 
 
487 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 
506 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 
486 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  29.59 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29 
 
 
511 aa  130  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 
494 aa  130  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 
507 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 
477 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 
476 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26 
 
 
481 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 
488 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 
508 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 
502 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 
531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 
500 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 
584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 
479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 
549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 
486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 
495 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 
487 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 
548 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 
523 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 
519 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 
503 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 
513 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 
484 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 
534 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 
478 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 
501 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 
549 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 
514 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 
579 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 
568 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 
557 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 
561 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 
510 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 
529 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 
492 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.09 
 
 
511 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 
498 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.4 
 
 
490 aa  97.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.65 
 
 
531 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 
494 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 
548 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 
483 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 
503 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 
522 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 
493 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25 
 
 
497 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  25.31 
 
 
504 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 
527 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 
485 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 
514 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 
557 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 
664 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 
532 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 
537 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 
565 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  24.48 
 
 
507 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 
498 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 
568 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 
639 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 
486 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 
557 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25 
 
 
540 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>