More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6739 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 513 aa  1060    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  49.32 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  33.91 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  35.39 
 
 		 493 aa  219  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.91 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.84 
 
 		 476 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 499 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  33.53 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  33.48 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.27 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 491 aa  180  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  32.27 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  30.5 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 479 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.98 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.87 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  29.41 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  31.87 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 497 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 460 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 502 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 498 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 511 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.21 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 534 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 477 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 448 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 497 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.87 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 480 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 555 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 549 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 512 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 565 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 485 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.64 
 
 		 476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 529 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 579 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 548 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 582 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 498 aa  110  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 496 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 509 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.7 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.84 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.09 
 
 		 507 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 549 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>