281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5797 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  56.64 
 
 		 588 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  64.84 
 
 		 592 aa  784    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 601 aa  1239    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  61.87 
 
 		 598 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  51.8 
 
 		 582 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  51.89 
 
 		 582 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  49.42 
 
 		 579 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  47.1 
 
 		 592 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  44.72 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  44.34 
 
 		 594 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  43.34 
 
 		 592 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  42.02 
 
 		 579 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  36.07 
 
 		 570 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  32.94 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.09 
 
 		 499 aa  183  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.98 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 477 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.11 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.01 
 
 		 499 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 483 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.48 
 
 		 498 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.45 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 506 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 511 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 494 aa  124  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 486 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 508 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 491 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 561 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 503 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 505 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  33.06 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 565 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 522 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 497 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 492 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 584 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  25.21 
 
 		 507 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 519 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 529 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 503 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 557 aa  90.9  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 506 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 514 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 568 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 537 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 540 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 549 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 473 aa  87.4  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 618 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  32.62 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  24.71 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  23.98 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 548 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 505 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 497 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 589 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  30.32 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>