More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1561 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 511 aa  1045    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  49.32 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  33.84 
 
 		 493 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  33.91 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 507 aa  173  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.44 
 
 		 499 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  30.57 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32.38 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.87 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  31.67 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 508 aa  153  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.91 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.94 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 486 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 460 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 481 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.63 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.92 
 
 		 490 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 504 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  29.38 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.1 
 
 		 503 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 601 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 488 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  29.48 
 
 		 588 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 594 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 505 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 570 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 511 aa  110  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 532 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.68 
 
 		 511 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.36 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 542 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 533 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 447 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 519 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  31.51 
 
 		 549 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 511 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 579 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 447 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  32.08 
 
 		 555 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 561 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 480 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 579 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>