250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2765 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 542 aa  1126    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  53.87 
 
 		 543 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  53.83 
 
 		 538 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 493 aa  250  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  33.69 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  31.41 
 
 		 504 aa  233  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 527 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 539 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  30.02 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.66 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  31.25 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 530 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 513 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  30.77 
 
 		 519 aa  153  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 515 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  23.56 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.71 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.09 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 506 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.18 
 
 		 507 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 477 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.74 
 
 		 498 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 574 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  24.3 
 
 		 511 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 555 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.52 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.82 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 488 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 560 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 498 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 490 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 565 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 559 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 477 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 572 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  38.89 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.48 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  21.67 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  22.74 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  25.24 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 548 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  38.4 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  22.45 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 557 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  23.11 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 540 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 528 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.48 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>