260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2218 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 566 aa  1168    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  39.11 
 
 		 560 aa  334  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  35.53 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  35.4 
 
 		 574 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 542 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 544 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 610 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 594 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 633 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 573 aa  133  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  23.31 
 
 		 667 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 556 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 537 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 561 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 555 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  41.92 
 
 		 548 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 549 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 519 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 510 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 480 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  41.92 
 
 		 533 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 479 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  37.72 
 
 		 604 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  25.08 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 497 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  22.9 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 612 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  38.17 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  33.18 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.7 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  35.33 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.94 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  21.83 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.05 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 664 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  37.98 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  38.78 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 613 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  22.08 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  36.76 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  23.48 
 
 		 531 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  40.3 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.52 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.38 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 522 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  36.17 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.04 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  33.56 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  37.4 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  35.07 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>