296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0629 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 540 aa  1102    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  49.82 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  43.71 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  43.19 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  40.33 
 
 		 519 aa  369  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  31.15 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 542 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  29.72 
 
 		 504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 537 aa  137  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 539 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 543 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 564 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 533 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.44 
 
 		 490 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 501 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 510 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  28.41 
 
 		 461 aa  97.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 540 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 557 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 480 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 620 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.92 
 
 		 599 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 572 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 575 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 541 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  28.8 
 
 		 537 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 551 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 548 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 566 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 492 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 519 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 531 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.7 
 
 		 507 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 547 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 565 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  23.93 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.29 
 
 		 499 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 548 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.32 
 
 		 494 aa  88.2  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 499 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  25.33 
 
 		 557 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 577 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 521 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 479 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 506 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 477 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 452 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  36.88 
 
 		 562 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  21.31 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 559 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.25 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.98 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>