269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1406 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 534 aa  1097    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  47.81 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  46.52 
 
 		 530 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  43.19 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  43.65 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  35.17 
 
 		 493 aa  193  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  30.86 
 
 		 502 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 539 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  28.16 
 
 		 537 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  29.04 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 543 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 515 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 539 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.55 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 487 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 483 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 479 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 514 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 564 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 469 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 556 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.4 
 
 		 499 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.68 
 
 		 511 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 541 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 544 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 494 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 479 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  38.85 
 
 		 562 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 531 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.39 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 451 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 486 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  32.66 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  39.85 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.05 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.67 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.18 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>