290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2268 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 574 aa  1182    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  34.87 
 
 		 551 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  35.4 
 
 		 566 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  31.9 
 
 		 544 aa  173  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 610 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 608 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 633 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 583 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 509 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 573 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  25.04 
 
 		 530 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 542 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 522 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 506 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 557 aa  94  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.55 
 
 		 534 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 521 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 476 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 499 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 491 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  43.8 
 
 		 555 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.55 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 499 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.03 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 624 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 562 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  27.48 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 601 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  23.87 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  36.2 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  25.24 
 
 		 667 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  26.14 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  24.35 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  23.94 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 559 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 612 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  31.84 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 511 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  37.88 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  31.09 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>