223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1389 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 583 aa  1214    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  43.62 
 
 		 610 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  42.18 
 
 		 608 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  35.18 
 
 		 633 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  31.5 
 
 		 667 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 566 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  31.83 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 544 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 574 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 565 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 548 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 549 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.27 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  38.53 
 
 		 514 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  34.9 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  30.11 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  33.97 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  31.29 
 
 		 555 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 540 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  35.24 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 622 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 612 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.2 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  36.45 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 487 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  31.97 
 
 		 602 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  32.48 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  23.75 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  23.22 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  22.71 
 
 		 530 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  31.45 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  35.17 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.85 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 527 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 480 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  35.65 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.29 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  25.42 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  32.43 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  22.48 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  43.18 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 494 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  22.55 
 
 		 557 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  21.03 
 
 		 524 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 549 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  33.65 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  39.02 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>