149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5704 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  68.37 
 
 		 562 aa  785    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 564 aa  1171    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  35.12 
 
 		 588 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  36.97 
 
 		 587 aa  300  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  33.22 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  33.94 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  30.72 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  26.7 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.42 
 
 		 502 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 540 aa  123  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 538 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 530 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  46.94 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 527 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  26.42 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 578 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 577 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 561 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 594 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  30.99 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  24.81 
 
 		 624 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.76 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  32.62 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  22.6 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  30.23 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.97 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  36.76 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  36.64 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  36.3 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  35.66 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  37.4 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 531 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  32.12 
 
 		 480 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  34.23 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 601 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  35.04 
 
 		 458 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  35.97 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 626 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  33.99 
 
 		 469 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 486 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 509 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 608 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  23.04 
 
 		 582 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 601 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  34.33 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  32.76 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 448 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 503 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.11 
 
 		 494 aa  50.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 579 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  39.74 
 
 		 667 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 520 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  34.88 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 633 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  39.51 
 
 		 583 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  35.58 
 
 		 437 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 571 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>