175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0022 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 562 aa  1164    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  67.43 
 
 		 564 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  37.34 
 
 		 588 aa  319  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  36.3 
 
 		 587 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  32.97 
 
 		 515 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  30.82 
 
 		 529 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  31.94 
 
 		 513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  29.34 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  28.45 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 527 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 530 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 538 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.77 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 530 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  39.16 
 
 		 539 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  38.85 
 
 		 534 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  30.07 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  36.88 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 574 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  33.96 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  35.86 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 624 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  34.39 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  39.37 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  39.83 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  35.46 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  36.57 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  40.74 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  22.5 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  38.33 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  23.14 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  38.06 
 
 		 566 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 601 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  25.65 
 
 		 557 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.41 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  37.07 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  33.76 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 544 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  37.88 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 583 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.8 
 
 		 479 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 608 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  34.33 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  38.3 
 
 		 520 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  34.51 
 
 		 533 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 541 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 491 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 592 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 626 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 561 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 520 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 460 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  42.5 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>