251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4490 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1390    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  41.2 
 
 		 633 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  37.88 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  36.2 
 
 		 608 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 566 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 481 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 483 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 594 aa  97.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 527 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 479 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 519 aa  87.8  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 514 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 579 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 664 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  35.42 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  29.96 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  22.44 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 477 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  29.93 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 511 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 604 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.36 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.69 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 540 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 484 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  32.08 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  31.76 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  31.45 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  26.67 
 
 		 646 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 491 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  27.19 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  24.61 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  32.52 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  32.31 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 461 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 531 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 524 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 555 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 602 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  45.21 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 588 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 448 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  26.34 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>