More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4254 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1145    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  35.3 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  32.11 
 
 		 556 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  30.68 
 
 		 537 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 573 aa  190  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 624 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  30.27 
 
 		 555 aa  174  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 542 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.46 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 608 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  24.83 
 
 		 530 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 601 aa  104  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 610 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  39.51 
 
 		 604 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  33.45 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.64 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.32 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 602 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 530 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 497 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 540 aa  90.5  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  25.26 
 
 		 750 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  40.94 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 502 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 506 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.65 
 
 		 532 aa  87  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 499 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  40.8 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  32.56 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.07 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 531 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  36.53 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.53 
 
 		 494 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 494 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  38.78 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  40.15 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  33.52 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  28.32 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 511 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  38.17 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 612 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.96 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  23.04 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  36 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 652 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 473 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  37.78 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  30.67 
 
 		 646 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>