187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1639 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1550    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 555 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 624 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 561 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  32.61 
 
 		 548 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 565 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 537 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 533 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  31.17 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 601 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.37 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 497 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 508 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 477 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.63 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 652 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.54 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  33.76 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  23.99 
 
 		 646 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.1 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 448 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  32.79 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  34.86 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 610 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 603 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1260  RagB/SusD domain protein  34.19 
 
 		 685 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296024  normal  0.398588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.92 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  35.77 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  35 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 480 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  35.25 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  34.74 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  37.63 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 583 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 608 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 473 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  29.66 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  25.95 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 521 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.29 
 
 		 490 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 587 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 514 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 519 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 490 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 508 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 522 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  34.15 
 
 		 523 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.17 
 
 		 451 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 503 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 491 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 557 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 542 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 527 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 527 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 457 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 488 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 592 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>