More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3951 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 491 aa  1014    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  85.5 
 
 		 494 aa  853    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.85 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 502 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 494 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.69 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 527 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  30.13 
 
 		 522 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 664 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 519 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 527 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 613 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 503 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.46 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.32 
 
 		 507 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 514 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.17 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.8 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 555 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 556 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  22.96 
 
 		 549 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 447 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 591 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 493 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 472 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 457 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.91 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 480 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 485 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 521 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 603 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.55 
 
 		 458 aa  93.2  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.34 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 626 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 511 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.8 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 618 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 514 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 506 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>