267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0771 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 591 aa  1224    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  36.61 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  34.05 
 
 		 592 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  36.23 
 
 		 622 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0184  RagB/SusD domain-containing protein  32.11 
 
 		 604 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 527 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  31.42 
 
 		 540 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 519 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  29.85 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 572 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.05 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 664 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 486 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.49 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 522 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 494 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.19 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 601 aa  98.2  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 503 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 495 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 491 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 490 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 520 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 499 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 534 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 491 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 503 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.6 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 514 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  22.94 
 
 		 521 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 502 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 494 aa  89.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 527 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  24 
 
 		 531 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 473 aa  87.8  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 489 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 511 aa  87  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  22.68 
 
 		 531 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 507 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  21.94 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.6 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.8 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.52 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 568 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  22.22 
 
 		 574 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.1 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.53 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  23.51 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 486 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>