151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0184 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0184  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 604 aa  1250    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  52.07 
 
 		 592 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  32.11 
 
 		 591 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 549 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 622 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 603 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 664 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 519 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 612 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.05 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 503 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 476 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.95 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.31 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.32 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 499 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  24.65 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 508 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  23.2 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.43 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 496 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.35 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  22.06 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  38.64 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  22.33 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 511 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 492 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 557 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  39.33 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 528 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 447 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 494 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 537 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 565 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 457 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  23.83 
 
 		 532 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 541 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  34.04 
 
 		 511 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  23.46 
 
 		 531 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  37.11 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  20.99 
 
 		 470 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 514 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 519 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 506 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 497 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  36.63 
 
 		 557 aa  50.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  22.45 
 
 		 534 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  31.46 
 
 		 484 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>