More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1761 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 539 aa  1109    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  39.27 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 527 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  34.39 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  31.32 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  34.32 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 539 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  30.18 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  29.66 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 538 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  28.24 
 
 		 588 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 564 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 562 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 577 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 587 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 557 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 487 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  28.08 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 530 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 540 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.68 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 480 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.66 
 
 		 534 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 486 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 494 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  32.02 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 541 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 565 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.91 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 522 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.13 
 
 		 494 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 488 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 508 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 523 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.27 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 531 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 494 aa  98.2  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 497 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.55 
 
 		 478 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 582 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 579 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.47 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 572 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 521 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 540 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 579 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.41 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 547 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 555 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 492 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 519 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 521 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 573 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 522 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.05 
 
 		 531 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 559 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.14 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  40.74 
 
 		 481 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 557 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>