92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4168 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  61.36 
 
 		 587 aa  757    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1221    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  36.95 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  35.12 
 
 		 564 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 515 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 513 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  27.02 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  26.18 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 537 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 539 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 543 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 493 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 575 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  23.61 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.13 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 530 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  31.62 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  34.81 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.49 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 493 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 494 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 555 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  33.08 
 
 		 519 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 527 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 608 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 599 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  22.3 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  34.4 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 583 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 512 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 499 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 549 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.66 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 478 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  22.26 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  22.34 
 
 		 533 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 582 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  22.41 
 
 		 514 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  36.89 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 499 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 591 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  32.8 
 
 		 551 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  21.84 
 
 		 664 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 592 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.4 
 
 		 490 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 547 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 506 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  35.11 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 594 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.81 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 582 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 602 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 565 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 579 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4506  hypothetical protein  29.57 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  29.38 
 
 		 451 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  34.52 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  29.35 
 
 		 667 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 466 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.44 
 
 		 498 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 492 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  33.08 
 
 		 494 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>