290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5091 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 530 aa  1093    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  51.31 
 
 		 530 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  49.82 
 
 		 540 aa  502  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  46.52 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  46.44 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 538 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30.98 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  30.76 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 542 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  28.08 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 515 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 543 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  28.27 
 
 		 504 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 539 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 564 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 491 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.71 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 574 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.45 
 
 		 490 aa  97.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 499 aa  97.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 492 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 488 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.68 
 
 		 499 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 527 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.99 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 494 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.33 
 
 		 458 aa  87.4  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 540 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.18 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.33 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  21.9 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.32 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.19 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 495 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 572 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.14 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.84 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  23.94 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  23.65 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>