283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1481 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 499 aa  1034    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  37.82 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  31.67 
 
 		 503 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 514 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.99 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.71 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.13 
 
 		 490 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  27.34 
 
 		 502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  26.88 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 478 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  27.41 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 477 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 497 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.48 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  29.44 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 530 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.77 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.1 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 534 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.91 
 
 		 507 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 594 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 507 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 537 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 549 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 499 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 557 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 530 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  26.41 
 
 		 504 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 529 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 479 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.98 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 491 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 519 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 538 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 548 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 509 aa  87.4  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 506 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>