283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05060 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1051    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  46.44 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  43.65 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  40.33 
 
 		 540 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  40.65 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  31.31 
 
 		 504 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 542 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 538 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 538 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 543 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 499 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.88 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  28.46 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 478 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.92 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.57 
 
 		 499 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 507 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 503 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 527 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 502 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 529 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.41 
 
 		 490 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  40.77 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  22.24 
 
 		 477 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.8 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  39.01 
 
 		 577 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.39 
 
 		 599 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 488 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.06 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.16 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 560 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.64 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  36.88 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  34.27 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  33.96 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.38 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  32.31 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  22.95 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  37.67 
 
 		 561 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  22.72 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 498 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 570 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 549 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>