More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4010 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 480 aa  986    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  43.3 
 
 		 461 aa  347  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  41.55 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  41.24 
 
 		 510 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  42.17 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  39.51 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  39.43 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  42.64 
 
 		 476 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  42.77 
 
 		 480 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  40.08 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  36.73 
 
 		 472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  36.87 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  38.14 
 
 		 469 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  38.84 
 
 		 479 aa  272  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  37.89 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  39.11 
 
 		 462 aa  269  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  39 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  37.42 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  36.38 
 
 		 471 aa  256  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  35.6 
 
 		 471 aa  252  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  36.64 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  35.02 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  31.99 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 478 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 483 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.58 
 
 		 494 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  29.9 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 501 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.08 
 
 		 490 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 447 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.19 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 491 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.39 
 
 		 499 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 514 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  31.1 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.68 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.57 
 
 		 507 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.33 
 
 		 498 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 603 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.01 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 542 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 664 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.73 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 451 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>