More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1583 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 479 aa  984    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  49.48 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  44.11 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  42.12 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  40.77 
 
 		 477 aa  332  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  40.67 
 
 		 491 aa  326  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  40 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  40.49 
 
 		 478 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  38.74 
 
 		 500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  41.65 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  43.49 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  40.53 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  38.45 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  40.08 
 
 		 501 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  38.7 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  40.57 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  36.06 
 
 		 490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  38.37 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  37.82 
 
 		 497 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  37.58 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  36.76 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  35 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  35.39 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 486 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  36.36 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  34.69 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  35.66 
 
 		 519 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  37.72 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  37.7 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  36.02 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  34.52 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  34.12 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  36.98 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  33.27 
 
 		 510 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  33.74 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  32.61 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  34.64 
 
 		 492 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  35.24 
 
 		 487 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 514 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  31.42 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  33.13 
 
 		 481 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  32.35 
 
 		 541 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  32.94 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  33.14 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.03 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  32.54 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  31.8 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  31.57 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.5 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  30.49 
 
 		 507 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 523 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 503 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  32.45 
 
 		 456 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  31.32 
 
 		 461 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  31.04 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  31.07 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.75 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  34.05 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 549 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 513 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  29.39 
 
 		 506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.18 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 494 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  33.51 
 
 		 499 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 522 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  31.92 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  31.19 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  32.37 
 
 		 603 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 531 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 556 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>