More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0755 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 494 aa  1015    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  39.8 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  38.45 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  38.1 
 
 		 490 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  40.2 
 
 		 486 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  38.37 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  37.27 
 
 		 477 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  37.01 
 
 		 479 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  34.65 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  35.36 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  36.14 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  34.53 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 499 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  37.04 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  33.85 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.28 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 497 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  33.62 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 499 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  33.13 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  31.46 
 
 		 500 aa  193  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 503 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  32.34 
 
 		 506 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.79 
 
 		 514 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  34.25 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 501 aa  186  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 494 aa  183  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  31.16 
 
 		 483 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  31.48 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.21 
 
 		 498 aa  180  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 519 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  31.47 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  31.74 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  32.67 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  31.87 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  31.26 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 495 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.47 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  30.38 
 
 		 513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30.21 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 510 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 519 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.71 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.27 
 
 		 508 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  30.78 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 506 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  31.13 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 540 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 541 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.26 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.13 
 
 		 527 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.55 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 549 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  29.7 
 
 		 498 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  28.89 
 
 		 511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.67 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 531 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 491 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 488 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 490 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>