More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1499 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 519 aa  1079    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  45.07 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  41.13 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  47.2 
 
 		 603 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  44.44 
 
 		 664 aa  319  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  44.12 
 
 		 612 aa  316  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  41.04 
 
 		 613 aa  292  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  40.89 
 
 		 626 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  40.32 
 
 		 618 aa  282  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.42 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.13 
 
 		 490 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 481 aa  193  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.47 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 483 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 591 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 601 aa  166  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.89 
 
 		 494 aa  163  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.23 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 481 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 494 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 521 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 495 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 522 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 521 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 487 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.26 
 
 		 498 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 499 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.55 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 488 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 483 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 523 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.38 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 529 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 582 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 490 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 549 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 541 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 564 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.78 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.4 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 561 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 556 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.75 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>