277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2843 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 622 aa  1282    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  45.97 
 
 		 549 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  34.92 
 
 		 603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  36.54 
 
 		 591 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 613 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  32.45 
 
 		 626 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  31.84 
 
 		 618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  33.92 
 
 		 540 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 612 aa  220  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 664 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 519 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  31.29 
 
 		 486 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.6 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 476 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 601 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0184  RagB/SusD domain-containing protein  27.72 
 
 		 604 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 529 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 527 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 522 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.76 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 494 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.27 
 
 		 494 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.77 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 531 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 470 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 494 aa  97.8  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 531 aa  97.8  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 510 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 481 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  24.13 
 
 		 531 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.22 
 
 		 511 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 507 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 478 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 499 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 503 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 506 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 497 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 493 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 514 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 476 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 577 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 480 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 511 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 504 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 478 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 461 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  32.02 
 
 		 456 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 473 aa  88.2  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 483 aa  87  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.32 
 
 		 458 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.51 
 
 		 498 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 513 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  25.21 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.46 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>