250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4815 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 577 aa  1192    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 611 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 602 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 606 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  31.91 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 576 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 590 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 540 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 579 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 550 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 531 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 650 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.66 
 
 		 531 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 549 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 529 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 540 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 584 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  23.46 
 
 		 565 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 622 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 494 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 664 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  22.71 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  37.04 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  23.22 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.98 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 599 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  22.54 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 631 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 548 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  21.7 
 
 		 568 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  22.92 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 495 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  22.18 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  22.78 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  33.08 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  22.94 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  23.36 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 627 aa  70.5  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  21.56 
 
 		 582 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  23.34 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.44 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.66 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.3 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  21.78 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.88 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  27.44 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 570 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  21.48 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  21.44 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>