More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3421 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  100 
 
 
521 aa  1080    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  93.47 
 
 
521 aa  1000    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  65.5 
 
 
527 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  59.64 
 
 
522 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  43.84 
 
 
499 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  35.54 
 
 
503 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  36.01 
 
 
495 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  34.45 
 
 
522 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  32.45 
 
 
502 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  35.08 
 
 
483 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  34.61 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.05 
 
 
486 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.49 
 
 
490 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  33.52 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 
477 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 
479 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 
494 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.45 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 
477 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 
491 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 
499 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 
481 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 
480 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 
519 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 
506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 
494 aa  147  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 
498 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 
501 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 
549 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 
479 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.62 
 
 
506 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 
506 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.14 
 
 
507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 
497 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 
612 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 
512 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 
540 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 
537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 
511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 
481 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 
503 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 
491 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 
549 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 
496 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 
506 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 
492 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 
534 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 
527 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 
514 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 
488 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.97 
 
 
487 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 
507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28 
 
 
492 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 
511 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 
497 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.24 
 
 
498 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 
510 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 
622 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25 
 
 
531 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 
556 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 
470 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 
541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 
573 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 
565 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.52 
 
 
460 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 
487 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 
494 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 
473 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 
521 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 
531 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 
618 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.31 
 
 
532 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 
603 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 
490 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 
489 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 
548 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 
519 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 
541 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 
531 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 
456 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.62 
 
 
511 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 
485 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 
582 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 
503 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 
664 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 
510 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 
522 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>