More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2081 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 473 aa  969    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  42.09 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  40.58 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  38.4 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  36.51 
 
 		 491 aa  272  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  36.33 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  36.13 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  37.02 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  34.91 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  35.48 
 
 		 481 aa  249  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  35.87 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  37.89 
 
 		 514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  39.01 
 
 		 498 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  35.46 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  35.31 
 
 		 486 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  35.61 
 
 		 478 aa  239  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  35.02 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  36.13 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  35.98 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  33.87 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.77 
 
 		 477 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  35.87 
 
 		 501 aa  219  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.54 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  35.84 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  33.13 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  33.62 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  32.52 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.99 
 
 		 506 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  33 
 
 		 493 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  32.55 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  32.21 
 
 		 512 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 499 aa  186  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  34.34 
 
 		 488 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  33 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 520 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  31.69 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  33.07 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.52 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.31 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.32 
 
 		 522 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  33.9 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 511 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 506 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 503 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  31.83 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 511 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  30.33 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 488 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 497 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 519 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.56 
 
 		 531 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 549 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.97 
 
 		 498 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  30.89 
 
 		 532 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 531 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.32 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 523 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  33.64 
 
 		 579 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 509 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 521 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 456 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 592 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 499 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 522 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 495 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 603 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>