More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4195 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 506 aa  1041    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  52.3 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  51.29 
 
 		 508 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.01 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  31.84 
 
 		 494 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.21 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.14 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.9 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.44 
 
 		 506 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 527 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 514 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 501 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 503 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  32.16 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 496 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 485 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  25.33 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.84 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 549 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 533 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.29 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 572 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 557 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.19 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 664 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 521 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.59 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 548 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.19 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 582 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 491 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 618 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 507 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 499 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 480 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 549 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 601 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 489 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.9 
 
 		 511 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 479 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>