More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4318 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 481 aa  984    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  44.12 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  44.14 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  44.11 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  38.9 
 
 		 502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  38.51 
 
 		 500 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  38.03 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  37.21 
 
 		 501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  37.55 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  37.5 
 
 		 498 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  36.76 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  37.05 
 
 		 497 aa  259  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  37.65 
 
 		 514 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  38.41 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  37.29 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  36.21 
 
 		 519 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  35.86 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.49 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  34.82 
 
 		 499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  35.06 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  35.08 
 
 		 506 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  35.83 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  35.25 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  36.23 
 
 		 511 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  34.61 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  33.27 
 
 		 494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  33.27 
 
 		 514 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  34.71 
 
 		 490 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  33.53 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  31.39 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  33.4 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  32.63 
 
 		 499 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 485 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  36.24 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  34.62 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  32.74 
 
 		 487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  32.88 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  32.21 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  35.31 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 531 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  31.32 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 534 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 448 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.13 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  32.74 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 506 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  30.75 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.29 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 488 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  32.32 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 491 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 519 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 457 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  29.39 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  32.38 
 
 		 511 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.78 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 541 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 506 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 503 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 521 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  31.18 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 521 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 549 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 452 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 664 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>