More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4233 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 511 aa  1051    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 476 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.7 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 502 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 479 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  30.63 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.16 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.76 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 500 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.72 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 498 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  28.75 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 508 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 532 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 549 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.62 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  29.84 
 
 		 507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  31.36 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 527 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 522 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.34 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 501 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.57 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  24.09 
 
 		 502 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 452 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  26.68 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 498 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.89 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.21 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.19 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  25.64 
 
 		 557 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  27.52 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 548 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>