More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3870 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 498 aa  1028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  35.59 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  33.52 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.48 
 
 		 507 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.38 
 
 		 494 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.08 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  33.13 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  31.43 
 
 		 499 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.02 
 
 		 490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 503 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.22 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  31.5 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 494 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.9 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 486 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 579 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 529 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 541 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 519 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 603 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 588 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 494 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 592 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 504 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 601 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 473 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  30.71 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  29.18 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 612 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 484 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 549 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 618 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 540 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 528 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 491 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.4 
 
 		 511 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 503 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.41 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 594 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 488 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 512 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 527 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  28.66 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 555 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  26.39 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 521 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 511 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>