More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5395 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 506 aa  1040    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  34.84 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 476 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 522 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 527 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.22 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 477 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  31.21 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  28.22 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 478 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.44 
 
 		 490 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.25 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  31.04 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 491 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 498 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 522 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 519 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 540 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 488 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 503 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 612 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 613 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 603 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 487 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 506 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 514 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.98 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 549 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 498 aa  123  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 497 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.76 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 469 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 511 aa  116  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 618 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 626 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 592 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 534 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 508 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 527 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 622 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 591 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.96 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>