More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5331 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 541 aa  1112    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  35.98 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.1 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  32.78 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  33.09 
 
 		 508 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  33.52 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  32.91 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  33.7 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.35 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.74 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.2 
 
 		 499 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  30.03 
 
 		 592 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 493 aa  180  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 549 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 473 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 588 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.29 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.2 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 576 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 592 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 582 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 494 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 548 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 481 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 568 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 531 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  30.35 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.04 
 
 		 498 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 600 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 579 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  32.4 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 594 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.39 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 592 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 593 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 557 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 470 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 584 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 540 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.81 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 527 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 571 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 555 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 579 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  28.47 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 532 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 522 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 521 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27.65 
 
 		 511 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 579 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 568 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 566 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 559 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 556 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>