More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2140 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 529 aa  1090    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  34.34 
 
 		 531 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 531 aa  237  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 584 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 489 aa  206  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  30.9 
 
 		 540 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  32.6 
 
 		 564 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  31.6 
 
 		 527 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.64 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 549 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  34.08 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 593 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  32.22 
 
 		 511 aa  193  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  30.81 
 
 		 565 aa  193  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  35.16 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.83 
 
 		 479 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  30.64 
 
 		 594 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  30.88 
 
 		 571 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  32.46 
 
 		 555 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 583 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  31.94 
 
 		 483 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.78 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 561 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.05 
 
 		 490 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32.41 
 
 		 481 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 541 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  32.52 
 
 		 550 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  31.23 
 
 		 582 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 540 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.06 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 615 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 568 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 623 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  33.83 
 
 		 566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  26.18 
 
 		 629 aa  153  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.06 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.01 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 612 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 613 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.66 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 540 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.42 
 
 		 508 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  30.38 
 
 		 627 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.88 
 
 		 473 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 664 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 620 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 629 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 514 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.94 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.17 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 581 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 488 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 519 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 642 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 494 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.74 
 
 		 666 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 622 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.82 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>