228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2475 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 623 aa  1294    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  85.23 
 
 		 615 aa  1111    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  48.14 
 
 		 615 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  49.1 
 
 		 625 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  49.68 
 
 		 626 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  33.81 
 
 		 561 aa  240  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 600 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  32.66 
 
 		 555 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 583 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 593 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 594 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 568 aa  160  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 599 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 587 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 587 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 565 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 529 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 582 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 531 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 505 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 633 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 557 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 607 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.39 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 549 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 629 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 611 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 673 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  25.83 
 
 		 629 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 579 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 620 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 579 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.62 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 642 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 581 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 528 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 627 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 617 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 576 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 477 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.5 
 
 		 582 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 595 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  21.01 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 540 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 638 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.42 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  22.02 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  21.42 
 
 		 596 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  21.74 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.79 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>